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科学家用冷冻电镜全面解析动物细胞一氧化二氮还原酶组装过程

来源:动力   2023年04月16日 12:15

力学(缺少:Nature)

据悉,NosDFYL 在恰巧十二烷基 β-D-牛奶苷(DDM)里面会被剥离出来,并被重组到糖二醇细胞器(GDN)和细胚膜支架交叉物(MSP)纳米盘里面,以 3.3-Å(纳米盘)或 3.04-Å(GDN 细胞器)的解析度进行时冷冻电镜观察。

NosL 在位点里面的前面立刻变得明了,其N端被类比到 NosL(C24)的人质内附着点,该肽链恰巧好毗邻细胚膜界面,而人质内附着点本身并没有人被类比。这种左至右明晰了 NosL 实际上颇为像以前提出异议的那样毗邻外细胚膜里面,而是毗邻细胚质细胚膜的外叶里面。

▲图 | 无氨基酸的 NosDFY 接受来自 NosL 的 Cu+(缺少:Nature)

在三个组如此一来部分的电磁力里面,ATP 传动装置的 NosD 的旋转轴文学运动控制着与其伙伴 NosL 和 N2OR 的电磁力,其具质电磁力模式可知图表。

负载铅的 NosL 只能在无氨基酸正常下与 NosDFY 联结,在这种正常下,NosD 上的铅联结点朝向细胚膜,允许 Cu+ 从 NosL 分散到 NosD。随后 ATP 与 NosF 的联结引发了 NosD 的旋转轴,而与细胚膜相连的 NosL 无法先是,导致其获释。

在这种羧基里面,NosD 现在可以通过相同的界面与 N2OR 电磁力,将其”含铅货物“分散到该底物的金属肽链。然后 NosF 里面的 ATP 降解使 NosDFY 回到其无氨基酸的开放羧基,而 N2OR 阴氯离子向细胚膜的移动再度将迫使其获释,并获释出 NosD 上 HMM 三联质的铅联结肽链,以装载 NosL 的另一个金属阳氯离子。

在任何一个正向,各自的电磁力伙伴的获释都是通过 NosD 的旋转轴文学运动机器地触发的,NosDFY 及其伙伴的位点的骨架颇为详细地显示了 ATP 传动装置的 NosD 的变形如何使的单伴侣 NosL 的单个铅氯离子逐步分散,再度制造如此一来四核 CuZ 簇。

因此,ABC 运质 NosDFY 作为一个跨细胚膜能量密度电子式,高效率地有助于新生底物与 NosD 的铅供质的联结和剥离,将一个主要的活病态输送交叉物更必要可靠性用为 ATP 传动装置的杠杆,跨越分隔两个非常相异的细胚下行的边界。

▲图 | 铅从 NosL 经 NosDFY 到 N2OR 的运送假设(缺少:Nature)

总之,该研究课题以 NosDFY 与 NosL 和 N2OR 底物组如此一来的交叉骨架为类比某类,这一骨架里面含有高度繁杂的铅肽链,能用冷冻电镜,交叉骨架的制造简而言之被完全展示。

在这一简而言之里面,NosDFY 作充当机器能量密度电子式的角色,而颇为直接起到输送作用。这项社会活动是科学家首次类比如此繁杂的 N2O 浓缩底物骨架,将为有机物 N2O 降解提供比较简单的观点支撑,并有望推动 N2O 浓缩降解的技术研究课题。

参考资料:

1、 Muller, C., Zhang, L., Zipfel, S., Topitsch, A., Lutz, M., Eckert, J., Prasser, B., Chami, M., Lu, W., Du, J., and Einsle, O. (2022). Molecular interplay of an assembly machinery for nitrous oxide reductase. Nature.

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